Progressivement, l'élévation des concours de l'Etat, l'autonomisation du centre hospitalier de Mamoudzou, le financement local des dépenses de santé ( retenue de 2 pour 100 sur les revenus) puis la généralisation de la sécurité sociale ( 2005-2006) ont permis de doter Mayotte d'équipements hospitaliers modernes et performants

la lutte contre la malnutrition chez les populations défavorisées ety contre les maladies endémiques ( palludisme et récemment chikungunya) reste au centre des préocupation sanitaires.